MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid lp5

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000957	ATA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000957	T	6	6	140	145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000957	T	6	6	213	218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000957	AAT	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000957	TA	3	6	248	253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000957	TA	3	6	256	261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000957	AAT	2	6	656	661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000957	AT	4	8	696	703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_000957	TAAA	2	8	711	718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000957	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000957	TA	3	6	1100	1105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_000957	A	6	6	1119	1124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000957	A	6	6	1161	1166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000957	ATA	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000957	TA	3	6	1611	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000957	TAT	2	6	1644	1649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000957	ATAA	2	8	1735	1742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_000957	AT	3	6	1785	1790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_000957	A	7	7	1818	1824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000957	ATT	2	6	1827	1832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_000957	CAAAA	2	10	1841	1850	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_000957	A	6	6	1915	1920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_000957	CTT	2	6	1948	1953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_000957	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_000957	TAAA	2	8	2021	2028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_000957	TTTA	2	8	3273	3280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000957	ATT	2	6	3314	3319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_000957	TAA	2	6	4339	4344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_000957	TAA	2	6	4358	4363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_000957	AT	3	6	4381	4386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_000957	TAA	2	6	4852	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_000957	TTG	2	6	4883	4888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_000957	AAT	2	6	4890	4895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_000957	TAT	2	6	4902	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_000957	CTA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_000957	AGA	2	6	5017	5022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_000957	TCC	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_000957	TTTAA	2	10	5124	5133	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000957	A	6	6	5152	5157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000957	AAT	2	6	5195	5200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000957	A	8	8	5220	5227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.